Отдел археологического наследия занимается в первую очередь проведением археологических исследований на территории Казахстана и сопредельных стран.
Сотрудники Института являются руководителями и участниками научных грантовых проектов, финансируемых по линии Министерства образования и науки РК, участвуют в международных научных проектах совместно с Научно-исследовательским институтом культурного наследия Республики Корея, Институтом археологии и этнографии Сибирского отделения Российской академии наук.
С 2015 года сотрудники Института организовали 35 археологических экспедиций на территории Казахстана, которые были посвящены изучению памятников от каменного века до появления ранних государств.

Отдел традиционной культуры НИИ «Халық қазынасы» проводит исследования в области изучения истории традиционной культуры и современных тенденций культуры казахского народа.
Сотрудники отдела занимаются изучением музыкального наследия, фольклорно-эпического наследия, декоративно-прикладного искусства казахского народа, ономастики различных регионов Казахстана и т.д.
В рамках популяризации и пропаганды казахского традиционного музыкального искусства проводится работа в виде круглых столов, мастер-классов, лекций-концертов, дискуссий, в которых раскрываются творчество народных композиторов, осуществляется знакомство с традиционным искусством, происходит возрождение забытых песен и кюев.

Отдел мониторинга и экспертизы объектов историко-культурного наследия проводит работы в нескольких направлениях.
Одним из приоритетных направлений Отдела является анализ и мониторинг современного состояния законодательной базы Казахстана по охране и сохранению памятников историко-культурного наследия. В этом плане проводятся работы по сбору и обработке актуальных законодательных документов Казахстана и сравнительно-сопоставительный анализ с аналогичными правовыми актами стран ближнего и дальнего зарубежья.
Другим немаловажным направлением Отдела является проведение комплексных мероприятий по геоинформационному картографированию и созданию базы данных историко-культурного наследия Сарыарки. Данный проект актуален в свете динамичного развития информационных технологий в ХХІ веке, и интеграционных возможностей IT-технологии в сфере мониторинга состояния историко-культурного наследия Казахстана.
Отделом запланировано регулярное проведение круглых столов, семинаров и сессий по отдельным аспектам охраны и сохранения историко-культурного наследия Великой степи, итогами которых будут издание сборников научных статей, методических рекомендаций, брошюр и т.д.